| 1η ΦΑΣΗ (29/08/2008) |
| 1 |
Αίας Σαλαμίνας – Ρόδος
|
2-1 |
| 2 |
Αναγέννηση Γιαννιτσών – Πρέβεζα
|
2-4 |
| 3 |
Αιολικός – Ηλιούπολη
|
4-5 |
| 4 |
Ατσαλένιος – Δόξα Δράμας
|
1-0 |
| 5 |
Αστέρας Ρεθύμνου – Μεσσηνιακός
|
0-2 |
| 6 |
Εθν. Ολυμπιακός Βόλου – Παναχαϊκή
|
2-0 |
| 7 |
Αναγέννηση Αρτας – Παναιγιάλειος
|
4-0 |
| 8 |
ΠΑΣ Κόρινθος – Κορωπί
|
4-1 |
| 9 |
Εθνικός Κατερίνης – Καβάλα
|
4-1 |
| 10 |
Προσοτσάνη – Θερμαϊκός
|
1-2 |
| 11 |
Πτολεμαΐδα – Αναγέννηση Καρδίτσας
|
2-1 |
| 12 |
Νίκη Βόλου – Αχαρναϊκός
|
2-1 |
| 13 |
Λαμία – ΠΑΟ Νέων Επιβατών
|
3-4 |
| 14 |
Ενωση Θράκης – ΑΕ Γιάννενα
|
1-0 |
| 15 |
Φωστήρας – Θήβα
|
5-1 |
| 16 |
Πολύκαστρο – Βύζας Μεγάρων
|
1-0 |
| 17 |
Διαγόρας Ρόδου – Θύελλα Πατρών
|
3-0 |
| *Ο Παναιτωλικός προκρίθηκε άνευ αγώνος στη 2η φάση. |
| |
| 2η ΦΑΣΗ (05/09/2008) |
| 18 |
Παναιτωλικός – Ιωνικός
|
4-0 |
| 19 |
Αίας Σαλαμίνας – Εθνικός Πειραιώς
|
0-2 |
| 20 |
Πρέβεζα – Καλαμάτα
|
4-2 |
| 21 |
Ηλιούπολη – Πιερικός
|
1-0 |
| 22 |
Ατσαλένιος – Πανθρακικός
|
1-0 |
| 23 |
Μεσσηνιακός – Πανσερραϊκός
|
4-3 |
| 24 |
Εθν. Ολυμπιακός Βόλου – Ηλυσιακός
|
3-1 |
| 25 |
Αναγέννηση Αρτας – Εθνικός Αστέρας
|
3-4 |
| 26 |
ΠΑΣ Κόρινθος – Αγιος Δημήτριος
|
1-2 |
| 27 |
Εθνικός Κατερίνης – Κέρκυρα
|
1-0 |
| 28 |
Θερμαϊκός – Καστοριά
|
1-2 |
| 29 |
Πτολεμαΐδα – Καλλιθέα
|
0-2 |
| 30 |
Νίκη Βόλου – Αιγάλεω
|
0-2 |
| 31 |
ΠΑΟ Νέων Επιβατών – Θρασύβουλος
|
1-2 |
| 32 |
Ενωση Θράκης – ΑΣΚ Ολυμπιακός
|
1-2 |
| 33 |
Φωστήρας – ΠΑΣ Γιάννινα
|
2-1 |
| 34 |
Πολύκαστρο – Αγροτικός Αστέρας
|
2-4 |
| 35 |
Διαγόρας Ρόδου – Χαϊδάρι
|
2-0 |
| |
| 3η ΦΑΣΗ (26/09/2008) |
| 36 |
Παναιτωλικός – Φωστήρας
|
– |
| 38 |
Μεσσηνιακός – Ατσαλένιος
|
– |
| |
| 4η ΦΑΣΗ (10 & 31/10/2008) |
| 39 |
Εθνικός Πειραιώς – ΟΦΗ
|
– |
| 40 |
Πρέβεζα – Βέροια
|
– |
| 41 |
Ηλιούπολη – Λάρισα
|
– |
| 42 |
Εθν. Ολυμπιακός Βόλου – Ηρακλής
|
– |
| 43 |
Εθνικός Αστέρας – Παναθηναϊκός
|
– |
| 44 |
Αγιος Δημήτριος – Άρης
|
– |
| 45 |
Εθνικός Κατερίνης – Λεβαδειακός
|
– |
| 46 |
Καστοριά – Πανιώνιος
|
– |
| 47 |
Καλλιθέα – Απόλλων Καλαμαριάς
|
– |
| 48 |
Αιγάλεω – SKODA Ξάνθη
|
– |
| 49 |
Θρασύβουλος – ΠΑΟΚ
|
– |
| 50 |
Θρασύβουλος – Ατρόμητος
|
– |
| 51 |
Αγροτικός Αστέρας – Εργοτέλης
|
– |
| 52 |
Διαγόρας Ρόδου – Ολυμπιακός
|
– |
| 53 |
Νικητής 36 – ΑΕΚ
|
– |
| 54 |
Νικητής 37 – Αστέρας Τρίπολης
|
– |
